2001年以来，国土资源局内设7个职能股（室、大队）：综合办公室，财务股，耕保利用股，规划地籍股，矿产地环股，测绘办，地产交易所。

　　综合办公室组织协调局机关日常工作、党务工作，负责有关文件的起草、会议的组织、文秘处理、信息综合、档案、保卫、接待、资产管理、人事管理、工、青、妇、计生和行政后勤等工作。

　　财务室负责财务及综合统计工作；负责国土资源各类资金的征收和使用的监督管理；负责做好季报、年报等各类报表及统计工作。

　　矿产地环股负责采矿、探矿权的审批、登记、发证；矿产资源的保护、调查、规划和开发利用；地质、矿产资源的综合管理和地质环境保护；依法征收矿产资源补偿费；负责地勘资料的汇交和管理，对权属交易行为进行监督检查。

　　规划地籍股监督实施全县土地利用总体规划；负责全县地籍统一管理，组织开展土地资源调查、地籍调查和变更调查、登记发证、土地使用证书年检；承担调处土地权属纠纷；负责土地确权和土地登记工作；负责土地统计和土地动态监测。

　　耕保利用股负责农地用途管制制度的实施和耕地保护的监督管理；农地转用审报批和各类建设用地的审报批；非农建设占用耕地补充方案的审批与管理；基准地价，标定地价的评测，农地分等定级工作；国有土地资产管理，依法规范土地使用权出让、租赁、转让、抵押、作价出资等交易行为。

　　综合测绘股（即“县测绘管理办公室”）负责组织、管理和实施全县基础测绘、行政区域界线测绘、地籍测绘；管理全县测绘单位资质认证和测绘任务登记；保护辖区内的测量标志、依法管理测绘市场；负责监督重大测绘项目的招标和测绘成果质量的确认，以及本县地图编制、审查、出版、展示等工作。

　　2012年5月，增设纪检监察室、土地开发整理中心、地质灾害监测中心三个内设机构。

　　直属事业机构。

　　1、沁源县执法监察大队

　　负责有关法律法规的宣传和贯彻落实，组织制定有关国土资源的规范性文件；协调依法行政工作，负责行政复议；组织对国土资源法律法规的执行情况进行监督检查；组织巡查、调查、查处违反国土资源法律法规的违法违纪案件；负责国土资源信访接待、统计、上报工作；负责干部职工的法律法规培训工作。

　　2、土地收购储备交易中心

　　沁源县土地收置、低效利用土地进行收购储备；对县城规划和旧城改造中需调整盘活的土地进行收购储备盘活；管理储备由县政府依法收回的违法用地、无主地（即无合法使用权的国有土地）以及因单位搬迁、破产、改制等原因闲置的土地；管理使用好土地收购、储备资金；承办国有土地使用权交易。

　　3、沁源县地质灾害调查中心

　　负责全县土地、矿产、地质环境基础信息和资源利用情况变化趋势动态资料的收集、技术处理及预测分析；负责各类国土资源工程测量、地形测量、矿山测量、建设用地、勘测定界等基础测量、测绘工作；负责组织国土资源数据库及系统网络建设；承担县级数据中心职责。

　　国土资源所

　　2006年7月，县政府常务会议研究同意成立沁河、李元、灵空山、郭道、聪子峪、王陶六个国土资源管理所，六个国土资源中心所为国土局直属事业单位，人、财、物由国土局统管，中心所组成人员从国土局内部事业编制人员中进行调配，不得增加财政负担。国土资源所其职能为：

　　负责辖区国土资源开发、管理、保护工作；负责非农建设用地及农村居民宅基地的审核、报批，做好辖区地籍调查、土地登记、权属变更等工作；做好辖区耕地，特别是基本农田的保护、管理和土地开发整理工作；负责矿山企业日常监督检查、资源综合管理、地质灾害防治工作；负责土地、矿业、测绘市场的日常动态巡查，严厉打击非法违法行为，履行国土资源检查权、调查权、制止权；做好国土资源来信来访接待工作，调处各类矛盾纠纷；做好矿补费、土地复垦费的代征、催缴工作；完成县局交办的其它工作。